Калининградская область является равноправным субъектом Российской Федерации, и систему органов государственной власти на своей территории она устанавливает самостоятельно в соответствии с Конституцией РФ и общими принципами организации представительных и исполнительных органов государственной власти, определенными федеральным законодательством.

Согласно Уставу (Основным Законом) Калининградской области систему органов государственной власти в регионе составляют:
– законодательный (представительный) орган государственной власти – областная Дума;
– высшее должностное лицо – глава Правительства (губернатор) области;
– высший исполнительный орган государственной власти – Правительство области, возглавляемая губернатором.

Административный центр области – город Калининград. Кроме него, здесь находится еще 7 городов областного подчинения (включая 3 городских округа) и 13 районов. Всего же на территории области расположено 22 города и 5 поселков городского типа.

Особое положение Калининградской области определило установление в 2001 г. должности заместителя полномочного представителя Президента Российской Федерации в Северо-Западном федеральном округе, в обязанности которого входит непосредственный контроль за ситуацией в области, а также координация деятельности в регионе федеральных структур.